Saç kökleri tüm ense bölgesinden ve kulak üstü bölgelerinden alınabilir, gerekirse vücudun diğer bölgelerinden (sırt, göğüs) bile kök alınabilir. Bu yüzden bir seans da, FUT yöntemine göre daha fazla kök alınabilir.
FUT-Alınabilecek kök sayısı sınırlıdır:Saç kökleri sadece enseden alınan şerit şeklindeki ciltten alınabilir. Bu yüzden bir seans da ekilebilecek kök sayısı sınırlıdır.
FUE-Kesi yapılmaz, iz kalmaz:Bu yöntemde saç kökleri tek tek alındığı için açılan yaralar iğne ucu kadardır; kanama minimumdur. Bu nokta şeklindeki minik yaralar 1 günde kapanır ve geride iz kalmaz. Kesinlikle iz bırakmayan bir yöntemdir.
FUT-Ensede uzunca bir kesi yapılır, kalıcı iz kalır:Ensede, bir kulaktan diğerine uzunca bir şerit şeklinde cilt kesilerek alınır ve açılan yara dikilerek kapatılır. Bu yöntemde ensede ki deride saçlar çok kısa kesildiği taktirde kıl inceliğinde ya da kalınlığında renk değişikliği oluşur.
FUE-Alınan köklerin hepsi seçilerek ekilir:Daha geniş alandan kök alındığı için alınan kökler seçilerek ince-kalın orantısına göre ekilir.
FUT-Seçim yapılmadan tüm kökler ekilir: Alınabilecek kök sayısı sınırlı olduğundan alınan tüm kökler ayırt edilmeden ekilir.
FUE-Kansız bir yöntemdir:Saç kökleri 0.7-0.9 mm.lik punch uçları ile alındığından kanama nerede ise hiç olmaz.
FUT-Kanamalı bir yöntemdir: Enseden 10-15 santimlik cilt şeritinin alınma işlemi diğer işleme göre bir miktar kan görülür.
FUE-Daha yoğun kök ekilebilir:Alım bölgesi geniş bir alan olduğundan Kök sayısında sabit kalınmaz. İhtiyacı karşılayacak kadar kök alımı yapılabilir.
FUT-Ekilecek kök adedi bellidir: Sadece belirli bir ölçüde alındığından elde edilecek kök sayısı sabit ve kısıtlıdır.Alan büyükse en az 5 ay sonra 2. bir seans gerekebilir.
FUE-İyileşme dönemi daha kısadır:Kesi ve dikiş olmadığından iyileşme dönemi 1-2 gün sürer.
FUT-İyileşme dönemi daha uzundur:Ensedeki dikiş hattının iyileşmesi 7-9 gün sürer.
FUE-Ensede uyuşukluk yada gerginlik hissi olmaz:Kesi olmadığından ense bölgesinde ya da kafanın başka yerlerinde uyuşukluk ya da gerginlik hissi olmaz.
FUT-Ensede bir süre hissizlik ve gerginlik olur:Ensede cilt şeridi alınıp dikiş atılan yerde bir süre his kaybı ve gerginlik olur.
FUE-Ücret, ekilecek kök sayısına göre belirlenir:Genellikle ücret, ekilecek kök sayısına göre belirlenir. Gereken kök sayısı kadar hatta bir miktarda fazlası (ihtiyaçlar hiç bitmez) toplanır.
FUT-Kaç kök ekilirse ekilsin ücret değişmez:Ücretin belirlenmesinde enseye uygulanan cerrahi işlem daha çok etkin olduğundan kaç kök alınırsa alınsın ücret değişmez.Fakat alınan parçanın büyüklüğüne göre fiyat oluşturulur.
FUE-İkinci seans için genellikle beklenmez:İkinci seans gerekirse hemen ertesi gün yapılabilir.Bazı hastalarda 3500-4000 kök ekmek gerekebilir. Bu hastalarda ilk gün 2000 kök ekilir, hemen ertesi gün de 1500-2000 kök ekilir.ihtiyaç varsa üçüncü günde devam edilebilir.
FUT-İkinci seans için 5-6 ay beklemek gerekir:Ensedeki gergin dikiş izi gevşemeden buradan tekrar saçlı cilt şeridi alınamaz. Bu yüzden en az 5 ay geçmesi gerekir.
FUE-Ağrısızdır:Kesi ya da dikiş olmadığı için ağrı duyulmaz. Yine de hastanın ağrı kesici kullanması mutlaka gerekir.
FUT-Ağrılıdır: Ensede uzunca bir kesi ve dikiş yapıldığı için 1-2 gün ağrılıdır.Ancak ağrı kesici kullanılır ise bu şikayet oluşmaz.
FUE-Pansumana gerek yoktur:Kesi, dikiş olmadığından, kanama olmadığından ve iyileşme 2 günde tamamlandığından pansumana ihtiyaç yoktur.
FUT-Pansuman yapmak gerekir: Ensedeki dikiş yerine en azından 10 gün pansuman yapmak gerekir.
FUE-Saçlar traş edilmektedir:Normalde FUE tekniğinde tüm saçlı alan 1 mm traş edilmektedir. Saç kökleri tek tek alınıp tek tek ekildiği için bu şarttır.Ekilecek alan küçük ise belli bir bölge kısaltılarak ta kökler toplanabilir.
FUT-Köklerin alınacağı ense tarafının traş edilmesi gerekmez: Saç kökleri ensedeki cilt şeridi ile birlikte alındığından, sadece köklerin alınacağı şerit bölgesi traş edilmektedir.